Команда apt remove видаляє пакет, але зберігає його конфігураційні файли, тоді як apt purge видаляє і сам пакет, і всі його конфігураційні файли.
Деякі конфігураційні файли можуть бути спільними для кількох пакетів, особливо якщо ці пакети є частинами одного програмного комплексу або використовують однакові налаштування (наприклад, бібліотеки або системні сервіси).
У такому випадку, якщо ти видалиш один із таких пакетів за допомогою команди apt purge, конфігураційний файл може залишитися на системі, якщо він потрібен іншому пакету, щоб уникнути порушення роботи останнього.
PS не знаю точно так це чи ні.